故事剧情承接上集，说郭靖与黄蓉来到桃花岛，西毒已带子欧阳克来向黄蓉求婚，黄药师以考试选婿，郭靖获胜得娶黄蓉为妻......

明万历年间，朝廷内忧外患不断，古龙镇上一家名为飞刀门的武馆也由于战乱而日渐萧条，师父老李飞刀和两个关门弟子--万里风和牛大春，一起过着不问世事的平静日子。好景不长，老李飞刀的结拜兄弟，起义军领袖郭靖明将女儿郭盈盈托付给老李飞刀照顾，与此同时老李飞刀青梅竹马的师妹，已被皇帝选为贵妃的牛婉君，也由于后宫斗争，带女儿芊芊和太监小顺子到飞刀门避难。这些人同在一个屋檐下却有着相反的立场，老李飞刀一边努力化解双方的隔阂，一边又要保护师妹不受皇后爪牙的袭击，牛贵妃在亲历了老李飞刀为自己所做的一切之后，与昔日的师兄再续前

南宋年间，全真教道士丘处机与江南七怪武功不相上下，两方决定各培养一个徒弟，日后比武来决定双方武功高低。丘处机的徒弟是金国小王子杨康（苗侨伟 饰），江南七怪的徒弟则是自小随母亲在蒙古生活的郭靖（黄日华

杨康的儿子杨过（古天乐 饰）自小被郭靖收养，郭靖希望他学好，于是送到了桃花岛跟黄药诗学习。杨过在桃花岛上整日被郭芙和大、小武欺负，一气之下独自出走了。杨过被古墓派的小龙女（李若彤 饰）收留，认她作

少年杨过（孟飞 饰）自幼失去了父母，所幸得到了江湖上赫赫有名的大侠黄蓉（沈海蓉 饰）和郭靖（向云鹏 饰）夫妇的收留，才不至于流落在凶险的江湖之中。然而，杨过天性叛逆而又倔强，屡屡闯下大祸，无奈之下

一纸契约，他娶她为妻，限令她两年内生下他的孩子，带着他的钱离开。婚内，他日日搂着他人欺辱她，为了心中残存的爱情，她忍。孩子还未出生，她的耐心用完了，彻底死心。