清末民初，袁世凯与日本人秘密签订的“七条”卖国条约的副本被革命党人截获。革命党人黄青山受命将副本送往总部，不料途中遭到清廷走狗肇箕一伙阻击，黄青山被害，秘密文件被劫。黄青山的夫人黄大嫂为查找杀夫真凶和

由于在现实生活中太过不顺，加上空地也无法玩耍，大雄和他的伙伴小夫、胖虎和静香决定进行史上最大规模的离家出走。同时，由于发生时空错乱，一名名叫古古儿的远古时代中国人来到20世纪的东京，后被大雄等发现，带到七万年前。原来古古儿所在的光明族被黑暗族侵略，而黑暗族的首领是来自未来世界的巨尊比，他妄图改变世界历史，但是在时光巡逻队的协助下，最后巨尊比的阴谋破产，而古古儿和他的部族来到了日本，成为日本人的始祖。舞台在七万年前的中国。